Независимые от культуры диагностические тесты - Безопасности пищевых продуктов

Что такое CIDT и как они влияют на болезни пищевого происхождения?

CIDT позволяют врачам быстро определить причину болезни пациента. Тем не менее, эти тесты не предоставляют информацию, необходимую для обнаружения и предотвращения вспышек болезней пищевого происхождения и мониторинга тенденций заболеваний.

Независимые от культуры диагностические тесты (CIDTs) изменяют способ, которым клинические лаборатории диагностируют пациентов с болезнями пищевого происхождения. Эти тесты могут идентифицировать общий тип бактерий, вызывающих заболевание в течение нескольких часов, без необходимости культивирования или выращивания бактерий в лаборатории. (Чистый бактериальный штамм, который растет, называется изолятом.) Эти тесты позволяют врачам быстро определить причину болезни пациента. Однако переход к CIDT означает, что клинические лаборатории могут прекратить культивирование или производство бактериальных изолятов у пациентов с болезнями пищевого происхождения. Например, процентная доля диарейных заболеваний Campylobacter, диагностированных только с помощью CIDT на сайтах FoodNet, увеличилась с 13% в 2012-2014 годах до 38% в 2018 году.

Без бактериального изолята от процесса культивирования ученые общественного здравоохранения не могут выполнить тесты, которые определяют штамм или подтип организма (например, отпечатки пальцев ДНК), характер резистентности или другие характеристики. Эта информация необходима для выявления и предотвращения вспышек, отслеживания устойчивости к антибиотикам и мониторинга тенденций заболеваний, чтобы узнать, работают ли профилактические меры.

Как CIDT влияет на способность должностных лиц общественного здравоохранения выявлять и предотвращать вспышки?

Микробиолог использует последовательность всего генома, чтобы определить ДНК-отпечаток бактерий, от которых кто-то заболел.

PulseNet, лабораторная сеть, объединяющая случаи болезней пищевого происхождения для выявления вспышек, извлекает важную информацию из бактерий, обнаруженных в образцах от больных людей.
PulseNet нужны бактериальные изоляты для определения точных штаммов, вызывающих заболевание людей, с использованием методов ДНК-дактилоскопии, включая новый точный метод, известный как секвенирование всего генома (WGS).
Должностные лица общественного здравоохранения проверяют данные PulseNet на наличие кластеров соответствующих отпечатков ДНК. Если эпидемиологи обнаружат, что кластер имеет общий источник, это называется вспышкой.
CIDT пропускают этап производства изолята, и в результате ДНК-отпечатки не могут быть получены для PulseNet. Без отпечатков ДНК от бактерий PulseNet не сможет продолжать обнаруживать кластеры.
Без обнаружения кластеров PulseNet вспышки могут даже не распознаваться, зараженные продукты могут оставаться на полках и в кладовых, может заболеть больше людей, и ценные возможности для повышения безопасности наших продуктов питания могут быть потеряны.
PulseNet предотвращает около 270 000 заболеваний в год и экономит около 507 млн. Долл. США в год на медицинских расходах и снижении производительности.

Как CIDT влияет на способность отслеживать и сдерживать устойчивость к антибиотикам?

Чиновники здравоохранения собирают информацию об устойчивости к антибиотикам, анализируя бактериальные изоляты после того, как они выращены в культуре.
Если культивированные бактериальные изоляты недоступны для анализа, мы не будем знать, насколько они устойчивы к антибиотикам. Это может повлиять на то, как лечится болезнь, и затруднить мониторинг тенденций резистентности во времени.
Мониторинг резистентности к антибиотикам иногда приводит к принятию регулирующих мер для защиты здоровья, таких как запрет использования фторхинолонов у домашней птицы после того, как научные данные показали, что его использование вызывает увеличение резистентности к антибиотикам Campylobacter, что приводит к болезням пищевого происхождения.

Это изображение показывает заключительную стадию процесса бактериальной культуры. Скопления чистых бактерий или бактериальных изолятов растут на культуральной чашке или чашке Петри.

Как CIDT влияют на способность отслеживать тенденции заболеваний?

CIDT могут улучшить нашу способность отслеживать определенные типы тенденций заболеваний, таких как заболевания, вызванные бактериями, вирусами или паразитами, для которых ранее практические тесты были недоступны.
CIDT не продуцируют бактериальные изоляты, которые необходимы для различения штаммов и подтипов бактерий. Таким образом, чиновники здравоохранения не могут отслеживать важные изменения в показателях заболеваемости, вызываемой конкретными типами бактерий.
- Это также ограничивает возможность обнаружения, расследования и контроля вспышек в нескольких штатах.
- Регулирующие органы и отрасли нуждаются в информации, полученной в результате расследований вспышек и тенденций заболеваний, для принятия мер по повышению безопасности пищевых продуктов.

Верх страницы

Потенциальные краткосрочные решения

CDC поощряет клинические лаборатории сотрудничать с лабораториями общественного здравоохранения, чтобы продолжить культивирование и изоляцию вредных бактерий от больных людей с положительными CIDT. Образцы пациентов с положительным CIDT для сальмонеллы, токсина, продуцирующего шига, кишечной палочки и шигеллы следует культивировать для выделения бактериального штамма. Отдельные лаборатории должны также сделать это для Campylobacter.
CDC рассматривает способы сделать последующие посевы проще и дешевле для клинических лабораторий.
CDC тесно сотрудничает с Ассоциацией общественного здравоохранения Laboratoriesexternal icon (APHL), должностными лицами общественного здравоохранения, регулирующими органами, диагностическими лабораториями, производителями наборов CIDT и клиницистами, чтобы убедиться, что культуры получены в клинических лабораториях, когда CIDTs положительны или положительны образец от пациента предоставляется лабораториям общественного здравоохранения, чтобы они могли его культивировать.
CDC поощряет компании, которые делают CIDT, разрабатывать тесты таким образом, чтобы бактерии оставались живыми, чтобы их можно было культивировать, если тест положительный.
CDC адаптирует системы эпиднадзора, такие как Сеть активного эпиднадзора за болезнями пищевого происхождения или FoodNet, для включения инфекций, диагностируемых только с помощью CIDT.

Потенциальные долгосрочные решения

CDC работает с партнерами над разработкой передовых методов тестирования, которые не требуют бактериальных изолятов для предоставления информации, необходимой должностным лицам общественного здравоохранения. Эти тесты могут также предоставить дополнительную информацию медработникам о потенциальной устойчивости микробов к антибиотикам или вероятности возникновения серьезных заболеваний

Эти нововведения находятся на ранних стадиях разработки и могут быть через годы после их внедрения. Исследователи надеются, что использование этих методов в конечном итоге устранит необходимость культивирования бактериальных изолятов у большинства пациентов и ускорит процесс выявления и устранения вспышек. Полученные из культуры бактериальные изоляты от пациентов еще долго будут необходимы для выявления возникающих проблем.

Верх страницы

Учить больше

Пищевые заболевания и культурально-независимые диагностические тесты
Будущее PulseNet

Связанные публикации

«Заражение патогенными микроорганизмами, передаваемыми через пищу, и влияние все более широкого использования независимых от культуры диагностических тестов для эпиднадзора - Сеть активного эпиднадзора за болезнями пищевого происхождения, 10 сайтов США, 2012-2015 годы»: еженедельный отчет о заболеваемости и смертности
Внешняя иконка «Экономическая оценка PulseNet»: Американский журнал профилактической медицины
Внешняя иконка «Внедрение общенационального секвенирования генома в реальном времени для улучшения обнаружения и расследования вспышек листериоза»: Клинические инфекционные заболевания
«Влияние культурно-независимых диагностических тестов на надзор программы будущих возникающих инфекций»: статья в журнале «Новые инфекционные заболевания»
«Бактериальные кишечные инфекции, выявленные с помощью независимых от культуры диагностических тестов - FoodNet, Соединенные Штаты, 2012-2014 годы»: еженедельный отчет о заболеваемости и смертности